Os quistos dos ovários após a gravidez in vitro não têm necessariamente um efeito sobre o feto, se forem quistos fisiológicos, normalmente não têm qualquer efeito, se os quistos forem grandes ou patológicos, terão um certo efeito. Se os quistos do ovário forem quistos fisiológicos, normalmente conhecidos como quistos do corpo lúteo, normalmente desaparecem por si próprios e não afectam o crescimento e o desenvolvimento do feto. Se o quisto do ovário for grande ou ocupar um lugar na pélvis, irá afetar o crescimento e o desenvolvimento do feto. Neste caso, para evitar a rutura do quisto ou a torção do quisto, o médico terá de avaliar o quisto e escolher o momento certo para a remoção cirúrgica. Se o quisto for maligno, pode ser necessário um tratamento posterior. Após a gravidez in vitro com quistos nos ovários, é necessário ir ao hospital para exames regulares e, se os quistos nos ovários afectarem a saúde do feto, é necessário fazer um tratamento cirúrgico sob a orientação do médico.