A maior desvantagem da desinfeção com ozono é a impossibilidade de controlar a concentração de ozono produzido. Abaixo da norma de segurança, não haverá efeito de desinfeção, e acima da norma, haverá reacções adversas, como náuseas e vómitos. O mau controlo da concentração de ozono na desinfeção com ozono é prejudicial para quem o utiliza. Em muitas famílias, o desinfetante de ozono tem sido utilizado como purificador de ar, a capacidade de desinfeção e esterilização é relativamente forte, a capacidade de desinfeção do que a luz ultravioleta, mas também não há poluição secundária, não só pode a desinfeção do ar interior, mas também capaz de eliminar a superfície do objeto do veneno, a capacidade de desinfeção é mais abrangente. Mas com a desinfeção por ozono, a concentração de ozono deve estar dentro da norma de segurança. Se for inferior à norma de segurança, não há efeito de desinfeção. Se for superior à norma de segurança, terá efeitos desfavoráveis para o utilizador, o que provocará reacções adversas no organismo, como nas vias respiratórias (por exemplo, tosse, espirros, etc.), nas vias digestivas (por exemplo, náuseas, vómitos, etc.), no sistema nervoso (por exemplo, tonturas, dores de cabeça, etc.), etc. Se ocorrer algum destes desconfortos, deve ser procurada assistência médica imediata.