A cirurgia de perfuração gástrica não causa infeção por tuberculose sob assepsia adequada. No entanto, pode causar infeção se houver crescimento de bacilos da tuberculose no espaço cirúrgico ou se entrar em contacto com pele ferida. A cirurgia de perfuração gástrica propriamente dita é feita principalmente através da abertura da cavidade abdominal para fechar a área perfurada. Com uma assepsia adequada, não deve haver crescimento de Mycobacterium tuberculosis em nenhum dos ambientes, instrumentos, etc., que são tocados durante o procedimento, pelo que a cirurgia de perfuração gástrica em si não causa infeção por tuberculose ou outras doenças infecciosas. A infeção por tuberculose é transmitida principalmente por contacto com o trato respiratório, o sangue ou a pele danificada. Por conseguinte, se a sala de operações não for devidamente esterilizada e o doente inalar Mycobacterium tuberculosis durante a cirurgia ou se a ferida cirúrgica for exposta aos organismos, pode desenvolver infeção por tuberculose após a cirurgia, mas não existe uma relação direta com a perfuração gástrica em si. Atualmente, a assepsia cirúrgica é melhor, pelo que não há praticamente nenhuma possibilidade de infeção por tuberculose ou outra doença infecciosa durante a cirurgia de perfuração gástrica, mas é possível fazer testes para detetar doenças infecciosas relacionadas após a cirurgia.