Não foi efectuada qualquer investigação sobre os efeitos dos cogumelos shiitake em água, pelo que se recomenda o consumo de cogumelos shiitake cozinhados. Não se recomenda o consumo de cogumelos shiitake crus em água porque, embora o valor nutricional dos cogumelos shiitake seja relativamente elevado, a demolha dos cogumelos shiitake em água não liberta totalmente os nutrientes dos cogumelos shiitake, e apenas uma pequena quantidade de substâncias solúveis em água, como vitaminas e polissacáridos solúveis em água, será libertada na água. Quando os cogumelos são demolhados em água fria, a enzima de desintegração da ribose presente nos cogumelos não é fácil de analisar, e os cogumelos podem deteriorar-se depois de demolhados durante muito tempo, levando ao crescimento de bactérias, o que pode prejudicar a saúde depois de bebidos. Se quiser beber água de shiitake, pode cozinhar com cogumelos shiitake, cozinhar e beber água limpa embebida em cogumelos shiitake; beber sopa feita com cogumelos shiitake; ou fazer sopa diretamente com água limpa embebida em cogumelos shiitake.