O facto de se ter tomado omeprazol para controlar a H. pylori pode afetar a precisão do teste. Após a toma de omeprazol, o ácido gástrico é suprimido e o valor do PH aumenta, o que é temporariamente desfavorável ao crescimento bacteriano, sendo provável que a pesquisa de H. pylori apresente um resultado falso-negativo, o que pode levar a um diagnóstico errado. Se estiver a tomar omeprazol, recomenda-se geralmente que pare de tomar o medicamento durante 2 semanas para fazer a despistagem da H. pylori. Além disso, outros medicamentos para o tratamento de perturbações gástricas, como o bismuto, medicamentos antibióticos como o citrato de potássio de bismuto, cefalosporinas e levofloxacina, têm de ser interrompidos durante 4 semanas, para evitar afetar a exatidão dos resultados da despistagem. Recomenda-se que consulte o seu médico sobre as questões de preparação antes do teste de H. pylori e que coopere com o seu médico para o tratamento ou terapia de acordo com os resultados após o teste.