Os efeitos secundários da toma de metronidazol desaparecem normalmente em 3 a 5 dias. Podem ocorrer efeitos secundários como dores de cabeça, náuseas e gosto anormal após a toma de metronidazol, mas a recuperação pode demorar mais tempo em doentes com neuropatia periférica persistente devido à utilização prolongada de metronidazol. A toma de metronidazol pode provocar uma série de efeitos secundários, como náuseas, vómitos, perda de apetite, dores abdominais, diarreia, gosto metálico na boca, dores de cabeça, tonturas, leucopenia, cistite, dificuldade em urinar, etc., sendo que a maioria destes efeitos secundários pode ser aliviada por si só no prazo de 3 a 5 dias após a interrupção do medicamento. No entanto, alguns doentes que tomam metronidazol durante um longo período de tempo podem sentir efeitos secundários como dormência dos membros e sensação anormal, que é causada por neuropatia periférica persistente após tomar o medicamento durante um longo período de tempo. Neste caso, é necessário parar de tomar o medicamento imediatamente e tomar medicamentos como a vitamina B6 e a metilcobalamina, e também pode ser tratado através de treino de reabilitação e outros métodos. Se ocorrerem efeitos secundários após a toma de metronidazol, deve ser consultado um médico e eliminado.