Os doentes com prostatite tomam medicação por diferentes razões, bem como para diferentes graus de gravidade da doença, que variam entre 1 semana e 6 semanas. A prostatite aguda deve ser tratada precocemente com terapia anti-infecciosa, que é normalmente administrada por via intravenosa, como cefotaxima, tobramicina, levofloxacina e outros medicamentos antibacterianos. Os doentes são eficazes durante cerca de uma semana a duas semanas após a administração. Os antimicrobianos habitualmente utilizados na prostatite crónica incluem a levofloxacina, a azitromicina e a doxiciclina, e o tratamento deve ser mantido durante quatro a seis semanas. Além disso, a prostatite crónica também pode exigir a aplicação de medicamentos como a tansulosina e a tertolodina para melhorar os sintomas urinários. Recomenda-se que os doentes com prostatite se dirijam ao hospital atempadamente para melhorar o exame auxiliar, a fim de clarificar a condição do doente e dar tratamento adequado à sua condição. A utilização de fármacos antibacterianos deve basear-se nos resultados da cultura bacteriana e dos testes de sensibilidade aos fármacos, e deve ser utilizada sob a orientação do médico, para não ser abusada, e deve garantir que o tempo, a quantidade, o curso completo do tratamento.