A camada muscular intrínseca é principalmente parte da mucosa de superfície no tracto digestivo. Dentro da mucosa do tracto digestivo do corpo, na parte inferior da camada mucosa, existem duas camadas de músculo liso, os anéis interno e externo, das quais uma porção das fibras musculares está localizada em torno da camada mucosa e regula os níveis de várias hormonas segregadas pelas glândulas do tracto digestivo, e a camada externa está ligada à camada muscular do tracto digestivo por tecido conjuntivo. A camada muscular intrínseca faz parte da camada mucosa, mas não faz parte da camada muscular do próprio tracto digestivo. A camada muscular intrínseca do tracto digestivo é o local onde os tumores benignos e malignos são mais prováveis de ocorrer. Se houver uma lesão na camada muscular intrínseca, é necessária uma gastroscopia ou outro exame para se fazer um diagnóstico definitivo e o tratamento é geralmente cirúrgico.