A principal vacina utilizada para prevenir a diarreia em crianças é a vacina contra o rotavírus, uma vez que muitas crianças, especialmente na infância, sofrem frequentemente de enterite por rotavírus, que causa diarreia e aumento das fezes semelhantes às dos ovos, o que pode levar à desidratação e perturbações electrolíticas, afectando seriamente a saúde da criança, pelo que as crianças são vacinadas contra o rotavírus. Depois de uma criança ter sido vacinada contra o rotavírus, as hipóteses de reinfecção são muito reduzidas e os sintomas, se os houver, são muito ligeiros.