Se a colonoscopia não revelar qualquer problema, mas o doente continuar a ter vontade de evacuar, considera-se que pode haver diarreia funcional ou síndrome do cólon irritável. Na clínica, a taxa de acerto da colonoscopia para o diagnóstico de doenças intestinais é muito elevada. Se não for detectada nenhuma anomalia na colonoscopia, mas o doente tiver o problema de ter vontade de evacuar, a primeira coisa a considerar é a existência de diarreia funcional ou de síndrome do cólon irritável. O problema de querer evacuar a toda a hora deve-se ao facto de o doente estar demasiado ansioso e tenso, e os sintomas podem ser significativamente reduzidos quando o doente deixa de se concentrar no problema da eliminação intestinal. Por isso, para esta doença, os doentes são aconselhados a concentrarem-se em coisas que considerem significativas ou agradáveis e a dedicarem-se a elas, e a fazerem psicoterapia, se necessário. Nos casos em que a colonoscopia está bem, mas os movimentos intestinais são constantes, consultar o serviço de gastroenterologia de um hospital normal e, se necessário, consultar um psiquiatra.