A complicação mais comum após a cirurgia de drenagem da bílis é a estricção dos canais biliares, uma vez que uma dissecção comum dos canais biliares, litotripsia e exploração dos canais biliares são normalmente necessárias. Deixa-se uma drenagem em T para drenar a bílis fora do corpo para evitar fugas de bílis para a cavidade abdominal e o subsequente desenvolvimento de peritonite. Com o tempo, isto pode levar à estenose local do ducto biliar e, em casos graves, à estase biliar secundária e à infecção. Há também uma tendência para a fuga da bílis para a cavidade peritoneal e para o desenvolvimento de uma peritonite restritiva, o que também pode levar à febre no doente. Há também uma tendência para a drenagem prolongada da bílis para levar a perturbações no ambiente interno, com distúrbios electrolíticos e desequilíbrios ácido-base. Por conseguinte, é também importante rever regularmente a função hepática durante o período de tratamento.