A gastroscopia requer um estômago vazio e, normalmente, é melhor efectuada de manhã. O jejum é necessário para a gastroscopia porque a presença de restos de comida no estômago pode interferir com a observação da estrutura do estômago, levando ao não diagnóstico de algumas lesões gástricas. Por conseguinte, é geralmente necessário manter um período de jejum de, pelo menos, 6 horas para a gastroscopia, pelo que, geralmente, não se deve ingerir alimentos após as 20 horas da noite anterior ao exame e deve manter-se o jejum de água antes do exame do segundo dia. Normalmente, a gastroscopia é melhor efectuada de manhã, uma vez que só é permitido comer depois de terminada a gastroscopia, pelo que a sua realização de manhã permite que o examinando coma o mais rapidamente possível, evitando tonturas, fraqueza e outros desconfortos causados por um jejum prolongado. Por conseguinte, recomenda-se manter um jejum rigoroso e um jejum antes da gastroscopia e, se necessário, consultar um profissional médico para um tratamento normalizado.