O agente de contraste utilizado no ultra-som é um agente de contraste de microbolhas, que é geralmente excretado através dos pulmões em cerca de 30 minutos, com o mínimo de efeitos secundários. Desde a introdução da ultra-sonografia, cerca de 2.000 pacientes foram submetidos a ultra-sonografia todos os anos e não houve casos de alergia aos agentes de contraste de ultra-sons. Os principais incluem dores de cabeça, náuseas, dor no local da injecção e sensação anormal, cuja incidência é também muito baixa, em cerca de 1-5%. Estas reacções são temporárias, suaves e ainda não requerem tratamento especial e normalmente não têm sequelas depois de terem diminuído.