Os sintomas de recidiva do tumor mesenquimal gástrico estão intimamente relacionados com o local da recidiva. No caso de recidiva localizada do tumor gástrico, as manifestações são dor abdominal, náuseas, vómitos e fezes negras. No caso de metástases hepáticas, a ecografia ou a TC de seguimento pós-operatório podem revelar lesões ocupantes no fígado. Quando ocorre disseminação peritoneal intra-abdominal e o tumor cresce até um certo ponto, o doente pode encontrar uma massa abdominal e até desenvolver dor abdominal e diarreia. Em caso de recorrência de metástases tumorais extensas, pode surgir obstrução intestinal, como náuseas, vómitos e paragem anal da defecação, o que requer tratamento médico atempado.