A hipertensão geralmente requer medicação a longo prazo e pode ser prejudicial, como dores de cabeça, tonturas e hipotensão postural. Os diferentes tipos de medicamentos anti-hipertensores têm efeitos adversos diferentes. Estes devem ser analisados fármaco a fármaco. Os diuréticos, como a hidroclorotiazida, podem provocar distúrbios electrolíticos: baixo nível de potássio no sangue, baixo nível de magnésio no sangue, baixo nível de sódio no sangue, elevado nível de amoníaco no sangue, etc., e anomalias metabólicas: elevado nível de glicose no sangue, elevado nível de lípidos no sangue, elevado nível de ácido úrico, etc. Bloqueadores dos canais de cálcio, como a amlodipina, os efeitos adversos comuns incluem rubor facial, dores de cabeça, vertigens, palpitações, edema do tornozelo. Inibidores do sistema renina angiotensina, como o captopril e o clorosartan, os efeitos adversos incluem hipercalemia, hipotensão, tosse seca irritante, edema angioneurótico. Entre os fármacos bloqueadores beta, como o propranolol, as reacções adversas incluem náuseas, vómitos e outras reacções gastrointestinais e, em casos graves, indução ou exacerbação de asma brônquica, insuficiência cardíaca grave, edema pulmonar, etc. Para além destes fármacos anti-hipertensores, existem muitos fármacos com diferentes mecanismos de ação, as reacções adversas também são diferentes, devem ser objeto de uma análise específica do fármaco, tomar as medidas correspondentes para minimizar os danos provocados pela utilização prolongada do fármaco.