A doença de Kawasaki tem tendência a recidivar abaixo dos 3 anos de idade. O factor de recidiva é o que resta da última infecção com sequelas cardíacas. Após os 8 anos de idade, se não houver recorrência, a recorrência é muito improvável. Sem tratamento eficaz, a incidência de aneurismas coronários é de cerca de 15% a 20%, mas a maioria dos aneurismas desaparece em 1-2 anos. No entanto, a maioria dos aneurismas desaparece num prazo de 1-2 anos. Mesmo que a doença esteja estável, é importante fazer um acompanhamento com o médico, verificar todos os indicadores laboratoriais e parar a medicação lentamente, de acordo com o estado da doença, para evitar a recorrência.