A própolis é benéfica para o corpo humano, mas existem alguns efeitos secundários fora da gama terapêutica, os mais comuns são os seguintes: o primeiro ponto é o envenenamento por chumbo, que se deve principalmente ao facto de a própolis estar contaminada com chumbo durante o processo de formação, e se for consumido demasiado, existe o risco de envenenamento por chumbo e acumulação excessiva de chumbo no corpo. O segundo ponto é que reduz a função digestiva. Isto porque o própolis tem muitos componentes antibacterianos que podem regular a flora intestinal, especialmente para algumas bactérias benéficas, que têm um certo efeito na matança, reduzindo a função digestiva do corpo humano. O terceiro ponto é que comer própolis pode causar alergias, o que é muito complexo e principalmente devido à constituição diferente de cada pessoa, especialmente para alguns doentes alérgicos. O quarto ponto é a asma. Isto porque o próprio paciente pode ter um historial de asma, que pode ser desencadeado por comer própolis.