A infeção por H. pylori requer normalmente cerca de duas semanas de medicação, uma vez que a infeção por H. pylori não controlada tende a agravar os sintomas da gastrite. O tratamento da infeção por H. pylori é geralmente feito com ppi ou antagonista do recetor h2, combinado com dois antibióticos, por exemplo, amoxicilina, metronidazol, claritromicina, furazolidona e outros medicamentos. Depois de tomar um curso de medicação e depois parar, é importante rever os testes C13 e C14 dentro de um mês para esclarecer se a H. pylori foi completamente eliminada. A HP tem uma grande força invasiva na mucosa gástrica, mas também conduz à hiperprolactinémia, pelo que a infeção por HP deve ser tratada atempadamente.