Não existe um curso de tratamento antibiótico e a necessidade de parar é baseada na recuperação do doente. Uma vez que os antibióticos têm um efeito anti-infeccioso, a administração frequente pode causar disbiose da flora intestinal. Para as infecções mais comuns, os antibióticos podem ser tomados durante cerca de 3 a 5 dias para proporcionar um bom alívio, altura em que podem ser interrompidos. Existem muitos tipos de antibióticos, sendo os mais comuns as penicilinas, as cefalosporinas, os aminoglicosídeos e as tetraciclinas. É importante notar que existem critérios rigorosos para a utilização e interrupção dos antibióticos, pelo que os doentes devem seguir as instruções do seu médico e não os tomar em privado ou interromper sem autorização para evitar efeitos adversos para a saúde.