Os quistos do chocolate ovariano são uma forma de endometriose e podem causar dor no pequeno abdómen, sobretudo durante a menstruação, quando a dor no pequeno abdómen piora, e podem frequentemente causar infertilidade ou hemorragia vaginal irregular. Uma vez identificada esta condição, ela é tratada prontamente, de preferência com cirurgia. Se a cirurgia não for realizada, à medida que o quisto do chocolate ovariano aumenta de tamanho, pode romper-se, o que pode ter consequências impensáveis. Uma ruptura do quisto do chocolate pode permitir que o endométrio dentro dele se implante em vários locais na pélvis, causando sintomas clínicos graves. Portanto, uma vez detectado um quisto de chocolate, é melhor ir ao hospital para cirurgia 3-7 dias após a menstruação.