O método antiviral para o estado de infeção crónica pelo vírus da hepatite B pode ser o interferão, mas o tratamento com interferão deve começar com uma função hepática que não seja demasiado anormal e não deve progredir para um grau significativo de cirrose. A aplicação contínua de interferão tem o potencial de eliminar completamente o vírus da hepatite B. No entanto, os efeitos secundários associados são também mais numerosos. A injeção prolongada de interferão pode levar a uma baixa contagem de glóbulos brancos, o que pode facilmente levar a infecções, e pode também causar uma reação semelhante à gripe com febre recorrente. Por conseguinte, é necessário um controlo regular e um tratamento sintomático. O método antivírico mais frequentemente utilizado para a hepatite B é o análogo de nucleósido oral, que corresponde a muito menos reacções adversas. No entanto, o análogo de nucleósido oral não consegue uma eliminação completa do vírus da hepatite B, tem de ser tomado durante um longo período de tempo e existe a possibilidade de resistência ao medicamento. Atualmente, o fármaco mais utilizado é o entecavir, podendo também optar-se pelo tenofovir. A toma simultânea deste fármaco deve ser revista regularmente para determinar se o vírus apresenta resistência ao fármaco.