A heparinização é útil na terapia trombolítica, pois tem a função de prevenir a trombose e combater o enfarte recorrente. No entanto, a necessidade de heparinização depende da patologia. A terapia trombolítica pode ser utilizada na recanalização farmacológica do tromboembolismo em vários órgãos, como no enfarte cerebral e no enfarte do miocárdio. Atualmente, os medicamentos trombolíticos mais utilizados na clínica são a uroquinase, a estreptoquinase e outros activadores de fibrinogénio não específicos. Os fármacos conseguem a trombólise ao quebrar a fibrina no trombo, mas não conseguem quebrar o fibrinogénio no sangue. À medida que o enfarte ocorre, a área local encontra-se num estado de hipercoagulação, os fármacos trombolíticos só podem decompor o trombo formado, mas não podem inibir a ação contínua do processo de coagulação, pelo que é necessária uma terapia anticoagulante e antiplaquetária para inibir a formação de novos trombos e evitar a reoclusão. A heparina é utilizada clinicamente com frequência, pelo que também é designada por heparinização. No entanto, é de notar que o momento das intervenções de heparinização no enfarte do miocárdio e no enfarte cerebral não é o mesmo; a anticoagulação e a trombólise não podem ser realizadas se houver risco de hemorragia e for necessária uma intervenção ou cirurgia num curto espaço de tempo. A anticoagulação e a trombólise não podem ser efectuadas se houver risco de hemorragia e se for necessária uma intervenção ou cirurgia num curto espaço de tempo.