Após a realização da gastroenteroscopia, se o diagnóstico do departamento gastrointestinal não tiver contra-indicações, após o exame é permitido tomar medicamentos. A gastroenteroscopia e a colonoscopia são ambas muito utilizadas em medicina e podem observar diretamente as lesões na área examinada. A gastroenteroscopia não pode ser realizada em doentes com perturbações cardiopulmonares graves, suspeita de choque ou perfuração gastrointestinal e doentes com AVC agudo. Após a gastroenteroscopia, se não houver desconforto gastrointestinal ou doença gastrointestinal, os doentes podem tomar medicação; se ocorrer desconforto gastrointestinal ou for diagnosticada doença gastrointestinal após a gastroenteroscopia, recomenda-se que os doentes não tomem medicação em privado e consultem um médico atempadamente e tomem medicação sob a orientação do médico. Recomenda-se que os doentes que sofram de desconforto gastrointestinal e que tenham de se submeter a uma gastroenteroscopia sigam as instruções do médico para evitar o agravamento do seu desconforto.