Os exames PET-CT causam uma certa quantidade de radiação no corpo humano, mas a dose de radiação não é muito elevada; a radiação do PET-CT para o corpo humano provém principalmente de duas partes, uma é PET e a outra é CT. A radiação para o corpo proveniente do CT é principalmente a radiação para o corpo proveniente dos raios X, que se situa normalmente entre 10-20mSv. Se o paciente estiver a fazer uma tomografia computorizada de baixa dose, esta é geralmente inferior a 10mSv. Portanto, a dose total de radiação é geralmente de cerca de 20-30mSv e normalmente não excede 50mSv, enquanto as doses de radiação abaixo de 50mSv são relativamente seguras para o corpo.