O mel natural pode ser armazenado corretamente durante 3 a 5 anos sem se estragar. O mel engarrafado que cumpre as normas nacionais tem geralmente um prazo de validade de 18 meses. O mel puro, natural e maduro é altamente concentrado e tem um prazo de validade longo, podendo ser conservado durante 3 a 5 anos sem se estragar, desde que seja corretamente preservado. O mel deve ser conservado num local fresco, ventilado e à prova de luz, podendo-se utilizar baldes de cerâmica, vidro e plástico não tóxico para armazenar o mel, evitando a utilização de recipientes metálicos que afectam o valor nutricional do mel. O mel naturalmente selado pode ser conservado durante 3 a 5 anos sem se estragar, mas o mel fermenta naturalmente com o tempo, e o mel fermentado tem um sabor azedo e um sabor alcoólico distinto. Recomenda-se não consumir mel mal fermentado, pois pode ser prejudicial para o organismo. O valor nutricional do mel engarrafado comprado nos supermercados diminui após o prazo de validade, pelo que não se recomenda o seu consumo. Na sua vida quotidiana, pode sempre prestar atenção ao ambiente de conservação do mel ou colocá-lo no frigorífico ou colocá-lo num local fresco, ventilado e que evite a luz, tanto quanto possível, o que pode efetivamente garantir que o mel não se deteriora.