A quimioterapia tem certos efeitos secundários e algumas pessoas são incapazes de tolerar a quimioterapia, principalmente porque pode levar a efeitos secundários multi-sistémicos, tais como queda ou perda de cabelo, perda de apetite, mau apetite, náuseas, vómitos e dor. Pode também levar à leucopenia, em casos graves de deficiência de granulócitos e febre, anemia, trombocitopenia, e neurotoxicidade. Os efeitos secundários da quimioterapia estão claramente relacionados com as drogas usadas na quimioterapia, algumas drogas como a cisplatina ou a bleomicina têm efeitos secundários mais graves, especialmente reacções gastrointestinais, nefrotoxicidade e bleomicina podem causar febre, pelo que o grau de tolerância à quimioterapia varia de pessoa para pessoa.