A causa mais comum de desconforto gástrico nas mulheres são os problemas ginecológicos, como a inflamação da cavidade pélvica, o derrame pélvico, a congestão uterina, a inflamação das trompas de Falópio, a inflamação dos anexos, etc. As doentes com miomas uterinos e quistos nos ovários também têm tendência para causar desconforto gástrico nas mulheres. Quando uma mulher está no seu período menstrual, também pode sentir dor de estômago, que também está relacionada com a congestão pélvica e a libertação de prostaglandinas. Neste caso, o diagnóstico pode ser confirmado através de um exame ginecológico. A barriga desconfortável também está relacionada com a gravidez, uma vez que a barriga aumenta e incha após a gravidez, o que pode provocar desconforto na barriga. No caso de uma gravidez ectópica, esta pode causar dor num dos lados do abdómen. As doenças gastrointestinais, como as cólicas intestinais, também podem provocar dores de barriga.