A hepatite por citomegalovírus tem geralmente um bom prognóstico após um tratamento eficaz e não afecta o tempo de sobrevivência normal.
A hepatite por citomegalovírus é sobretudo uma doença autolimitada, as manifestações clínicas são geralmente ligeiras, geralmente após tratamento sintomático ativo, pode ser completamente recuperada, e geralmente não conduz a uma inflamação hepática muito grave, o prognóstico é muito bom, e não afecta a esperança de vida normal.
A hepatite por citomegalovírus tende a ocorrer em algumas pessoas imunocomprometidas, como recém-nascidos, bebés e crianças pequenas, e adultos imunocomprometidos. Por conseguinte, recomenda-se a adoção de bons hábitos de vida, o ajustamento da estrutura alimentar e a prática de exercício físico adequado para melhorar a imunidade e evitar a infeção viral.