Na maioria dos casos, a tosse matinal precoce de uma criança, mas não tanto durante o dia, é causada por rinite alérgica. Nas crianças com rinite alérgica, há cócegas no nariz de manhã cedo, espirros e descarga nasal clara, e algumas crianças têm frequentemente uma tosse muito má de manhã. Isto acontece porque a rinite alérgica faz com que as secreções nasais fluam para trás pela garganta da criança à noite. Quando as crianças acordam de manhã, sentem-se muito desconfortáveis na garganta devido à mudança de posição, o que provoca uma tosse matinal. A tosse matinal é também causada pela temperatura corporal matinal e pela exposição da criança ao ar frio, o que alivia a tosse após a actividade durante o dia.