A descoberta de células escamosas atípicas no colo do útero durante um teste laboratorial de TCT no departamento de ginecologia significa que pode haver inflamação crónica do colo do útero que é responsável pelas células escamosas atípicas. Alternativamente, isto pode ocorrer após um DIU, e existe também a possibilidade de o colo do útero estar de facto doente, pelo que esta célula escamosa atípica não é particularmente significativa do ponto de vista clínico. Se houver inflamação, recomenda-se o tratamento activo da inflamação, e se houver um dispositivo intra-uterino, recomenda-se a sua remoção e posterior revisão. Além disso, se houver infecção por tuberculose, e se esta for combinada com infecção por HPV de alto risco, a colposcopia deve ser realizada, sendo o objectivo principal excluir a presença de lesões no epitélio cervical. Se houver uma lesão, esta deve ser tratada prontamente e, neste caso, recomenda-se uma revisão clínica regular.