É principalmente utilizado clinicamente em crianças com Ascaris suis. Após administração oral, podem ocorrer ocasionalmente náuseas, vómitos, dores abdominais, diarreia, dores de cabeça, sensação anormal ou urticária, que podem desaparecer logo após a descontinuação da droga. As crianças alérgicas podem sofrer de lacrimejamento, olhos a pingar, tosse, tonturas, sonolência e até mesmo asma. Em alguns casos, podem desenvolver manifestações tipo hepatite viral, constrição pupilar, desregulação e estrabismo paralítico. É contra-indicado em crianças alérgicas ao pagosan, em crianças com insuficiência hepática ou renal, distúrbios neurológicos ou historial de epilepsia. Potencialmente neuromuscularmente tóxico para os seres humanos, especialmente em crianças, o Protocosídio deve ser evitado para uso prolongado ou excessivo. As crianças com desnutrição ou anemia devem ser corrigidas antes de iniciar este produto. Em caso de overdose ou de reacções adversas graves a Proteus, deve ser procurada atenção médica imediata. Este produto pode causar convulsões quando utilizado com clorpromazina e deve, portanto, ser evitado na prática clínica.