O metronidazol deve ser tomado oralmente após uma refeição, uma vez que pode causar desconforto gastrointestinal grave, pelo que a sua toma após uma refeição pode reduzir a reacção ao tracto gastrointestinal. O metronidazol é um antibiótico vulgarmente utilizado contra bactérias anaeróbias. É vulgarmente utilizado na cavidade oral para prevenir infecções após a extracção dos dentes e para controlar a infecção em casos de periodontite e infecção periapical. Ao utilizar metronidazol na cavidade oral, é importante utilizar estes antibióticos em conjunto com o tratamento oral de rotina, por exemplo, em casos de pulpite dolorosa, infecção periapical dolorosa, peri-coronite dolorosa nos dentes do siso, etc., onde o tratamento adequado do dente é necessário. Isto pode então ser combinado com outros antibióticos, tais como metronidazol, para obter melhores resultados.