A cirurgia é a base do tratamento dos quistos do ducto tiroglosso em crianças, mas a cirurgia electiva pode ser realizada em crianças com menos de 2 anos de idade, com quistos pequenos ou na ausência de infeção.
Os quistos do ducto tiroglossal pediátrico são uma doença congénita comum, a maioria dos quais pode ser detectada antes dos 7 anos de idade. Está associado a um desenvolvimento anormal do ducto tireoglosso e é normalmente tratado com excisão cirúrgica; se o quisto do ducto tireoglosso também for complicado por infeção, tem de ser incisado e drenado primeiro, sendo depois operado numa segunda fase, após a inflamação ter diminuído.
No entanto, se o doente tiver menos de 2 anos de idade, o quisto for pequeno ou não houver infeção, a cirurgia pode ser efectuada sem qualquer urgência, mas é necessário um acompanhamento regular e, se for detectada qualquer anomalia durante o acompanhamento, o doente deve dirigir-se a um hospital normal para receber tratamento atempado. Além disso, as crianças a quem foi diagnosticado um quisto tiroglossal devem dirigir-se ao hospital atempadamente para evitar atrasar o seu estado.