A hiperacidez após a cirurgia pancreaticoduodenal é maioritariamente tratada clinicamente com medicamentos neutralizadores do ácido gástrico e inibidores da bomba de protões. Os medicamentos devem ser utilizados de acordo com a prescrição do médico. Em circunstâncias normais, quando o suco gástrico é segregado em excesso, a mucosa do intestino delgado segrega inibidores gastrointestinais (glucagon, colecistoquinina, péptido inibidor gástrico, etc.) para inibir a secreção de suco gástrico. Quando o pâncreas-duodeno é removido, a secreção de suco gástrico não pode ser regulada por feedback negativo e o suco gástrico é secretado em excesso. Quando a secreção de ácido gástrico é excessiva, podem ser utilizados fármacos neutralizantes do ácido gástrico, como o bicarbonato de sódio. Os efeitos adversos deste fármaco são arrotos (soluços), aumento secundário da secreção de ácido gástrico, dor e distensão gástrica, edema, aumento da tensão arterial e alcalose. É contraindicado em pessoas com restrição de ingestão de sódio e alergia aos que utilizam urotropina. Medicamentos inibidores da bomba de protões, como o omeprazol. As reacções adversas a esta classe de medicamentos são dores de cabeça, dores abdominais, obstipação, diarreia, flatulência, náuseas e vómitos. Esta classe de medicamentos não deve ser combinada com o nelfinavir e a rilpivirina e está contra-indicada em indivíduos alérgicos. Os doentes com hiperacidez após cirurgia pancreaticoduodenal devem ser observados prontamente e tratados de forma agressiva.