Os efeitos secundários do exame de cintilografia óssea são os efeitos secundários do agente de contraste. A reação mais comum é a erupção cutânea entre 2 a 4 horas após a injeção, e alguns doentes podem ter dores de cabeça, náuseas e febre periférica 30 minutos após a injeção, mas estes efeitos secundários desaparecem normalmente por si próprios no espaço de 2 horas. O exame de ECT óssea é geralmente isento de riscos, mas devido à necessidade de injetar um agente de contraste, um número muito reduzido de doentes pode apresentar erupções cutâneas, náuseas, dores de cabeça e outros desconfortos. No entanto, a quantidade de agente de contraste utilizada está dentro de uma dose segura e é geralmente totalmente metabolizada pela água potável em cerca de 48 horas. No caso do exame de cintilografia óssea, é importante ter em atenção que, após a injeção do agente de contraste e depois do exame, deve beber-se muita água para promover a absorção e a excreção do medicamento. Retirar do corpo objectos metálicos, como colares, chaves e moedas, durante o exame, para evitar que os resultados sejam afectados. Esvaziar a bexiga antes do exame e evitar reter a urina. Manter-se emocionalmente estável e não se mexer durante o exame. Se não conseguir colaborar devido a dores, podem ser utilizados analgésicos.