O muco amarelo nas fezes pode ser causado por enterite aguda e crónica. A enterite crónica causa danos na mucosa intestinal, que impede a absorção de água dos alimentos que entram no corpo, e provoca exsudação quando há inflamação no sistema intestinal, resultando em muco nas fezes, e muco amarelo quando há ulceração da mucosa intestinal. Para a enterite aguda, é necessário determinar se existe uma infecção bacteriana ou inflamação da mucosa gastrointestinal devido a outras causas. Se as fezes têm muco amarelo devido a uma condição não infecciosa, pode ser causado por ingestão de alimentos frios e irritantes ou por tomar medicação estimuladora gastrointestinal, o que causa principalmente perturbações do tracto intestinal, resultando na indigestão do sistema gastrointestinal, que por sua vez afecta a absorção de alimentos e água no corpo. A principal causa é uma perturbação no funcionamento do tracto intestinal, resultando numa má digestão do sistema gastrointestinal, que por sua vez afecta a absorção de alimentos e água no corpo, resultando em muco amarelo nas fezes.