Os principais efeitos secundários da zonisamida são perda de apetite, sonolência e fadiga. A zonisamida é utilizada principalmente para crises de grande mal, crises limitadas, crises de pequeno mal e status epilepticus. Os efeitos secundários da zonisamida incluem sonolência, fraqueza generalizada, perda de apetite, etc. Alguns doentes podem apresentar discinesia, elevação das aminotransferases, diminuição dos glóbulos brancos, diplopia e outras reacções em alguns doentes. Ao utilizar o medicamento, é necessário prestar atenção, o uso contínuo do medicamento não pode ser interrompido repentinamente ou reduzir a dose, é necessário rever regularmente a função hepática e renal do paciente, as mulheres que amamentam devem ser cautelosas. Este produto pode causar uma diminuição da atenção e da capacidade motora reflexa, pelo que os condutores e operadores de máquinas devem ser utilizados com precaução. Recomenda-se que os pacientes sigam as instruções do médico para evitar o agravamento da condição.