O objectivo do tratamento é restaurar os níveis séricos da TSH e da hormona tiróide para a gama normal, de modo a que os sinais e sintomas clínicos do hipotiroidismo desapareçam. A dose de tratamento depende principalmente da duração da doença do doente, da idade, do peso e das diferenças individuais. A função da tiróide deve ser acompanhada de perto durante o tratamento e a medicação deve ser ajustada de forma atempada. O hipotiroidismo é tratado com um único medicamento, ou seja, a suplementação da hormona tiróide, que é relativamente simples de administrar uma vez por dia e requer uma revisão regular até a função tiróide atingir a homeostase, e o tipo de medicação deve ser ajustado com frequência. Os efeitos secundários da medicação para o hipotiroidismo são relativamente poucos, pelo que os doentes devem tratar a doença correctamente, tomar a medicação e monitorizá-la atempadamente, e ajustá-la de forma a restaurar os indicadores normais e melhorar o desconforto o mais rapidamente possível. A situação de cada pessoa é diferente e a gravidade dos sintomas varia, pelo que os pacientes devem visitar um hospital regular, seguir os conselhos do médico e tratar os sintomas.