Comer acidentalmente alguma coisa e não estar em jejum não é normalmente uma boa ideia para a gastroscopia. Antes da gastroscopia, é geralmente necessário estar em jejum durante 6 a 8 horas ou mais para esvaziar o conteúdo do estômago, de modo a facilitar a observação da mucosa gástrica durante a gastroscopia e obter melhores resultados. A realização de uma gastroscopia depois de comer pode dificultar a observação da mucosa gástrica pelo gastroscópio, o que não favorece a obtenção de resultados de diagnóstico exactos, pelo que não se pode realizar a gastroscopia quando o estômago não é esvaziado depois de comer. Além disso, o próprio gastroscópio pode estimular a garganta e o esófago do doente, provocando náuseas, vómitos, etc., e a possibilidade de aspiração após a ingestão de alimentos aumenta consideravelmente, o que pode ser fatal em casos graves. Se precisar de fazer uma gastroscopia, tem de seguir as instruções do médico para se preparar para a gastroscopia, de modo a não ser incapaz de efetuar um exame normal e atrasar o exame.