Patientes com encefalite viral ligeira recuperam geralmente em 2-3 semanas, e o tempo de recuperação para casos graves demora 1-2 meses.
>Há muitos vírus que causam encefalite viral, sendo os mais comuns o vírus do herpes simples, o vírus do varicella-zoster, e o poliovírus. A maioria dos casos ligeiros apresenta dores de cabeça, vómitos, alterações ligeiras na consciência e personalidade, perda de memória, paralisia de membros, afasia, etc. Alguns pacientes podem procurar consulta psiquiátrica por comportamento psiquiátrico anormal. À medida que a doença progride, os pacientes podem desenvolver perturbações da consciência, tais como a consciência desfocada, delírio, ou mesmo coma. Os pacientes gravemente doentes podem morrer em qualquer altura devido a necrose parenquimatosa cerebral extensa e edema cerebral, e pode ocorrer um aumento da pressão intracraniana e mesmo uma hérnia cerebral.
O prognóstico da encefalite viral depende da gravidade da doença e se o tratamento é oportuno, e cerca de 10% dos pacientes podem ficar com sequelas, tais como paralisia e diminuição da inteligência em graus variáveis.