A gravidade da hiperplasia atípica da mucosa do seio gástrico não pode ser generalizada. A hiperplasia atípica é classificada como hiperplasia ligeira ou moderadamente grave e tem de ser combinada com sintomas endoscópicos específicos para determinar a gravidade da doença. A hiperplasia atípica ligeira está normalmente associada à infeção por Helicobacter pylori (HP) e pode ser tratada com uma terapêutica quádrupla, como omeprazol, citrato de bismuto e potássio, claritromicina e metronidazol. Com tratamento sistémico, a hiperplasia atípica ligeira da mucosa do seio gástrico pode ser curada se não for muito grave. Se a lesão tiver progredido para hiperplasia atípica moderadamente grave, pode ser acompanhada de erosões ulceradas ou lesões elevadas, que devem ser tratadas imediatamente com cirurgia relevante, pode ser considerado o tratamento endoscópico, como EMR e ESD, e é necessária uma revisão regular após a cirurgia. Se a mucosa do seio gástrico for uma hiperplasia atípica ligeira, deve estar-se atento à progressão da doença para hiperplasia atípica moderada ou grave ou carcinoma. Deve-se ir regularmente ao hospital para efetuar uma gastroscopia e outros exames relevantes para observar a evolução da doença e evitar o seu agravamento.