Uma fístula anal de 10 anos não afecta a esperança de vida, pelo que o tempo exato de vida varia de pessoa para pessoa e não pode ser generalizado. De um modo geral, a fístula anal não afecta a esperança de vida, pelo que não há dúvida sobre quanto tempo se pode viver após 10 anos de doença. E a fístula anal é uma doença benigna, embora exista uma certa probabilidade de cancro, mas a probabilidade de cancro é muito pequena. Para os doentes em mau estado físico, como os doentes idosos que sofrem de doenças cardiovasculares e cerebrovasculares graves ou de insuficiência renal grave, recomenda-se geralmente que os doentes vivam com fístula. Para os doentes saudáveis e em boas condições físicas, é normalmente possível efetuar um tratamento cirúrgico. A cirurgia inclui a fistulotomia anal, que é indicada para a fístula anal aguda e pode ser cortada e drenada. Existe também a suspensão da fístula anal, que consiste em atar um fio de seda ou um elástico e utilizar pressão mecânica ou constrição para embotar o tubo e incisá-lo lentamente. Existe também a fistulotomia anal, utilizada para tratar fístulas anais estáveis, em que a fístula é removida diretamente. Recomenda-se que a cirurgia da fístula anal seja realizada logo que seja fisicamente possível, para que a fístula não afecte a qualidade de vida do indivíduo, e quaisquer anomalias devem ser tratadas prontamente.