Existem muitas doenças associadas à diarreia com sangue e muco, e a medicação específica a tomar deve ser adaptada à doença e à causa. Se se tratar de uma gastroenterite aguda simples, devido à gravidade da diarreia, a irritação da mucosa intestinal leva a uma hemorragia localizada da mucosa intestinal, e o aparecimento de muco e sangue pode ser aplicado com uma protecção adequada da mucosa, medicamentos antidiarreicos e medicamentos anti-infecciosos, como montelucaste, difenoxilato, bifidobactérias, norfloxacina, etc. Em caso de colite ulcerosa ou de doença de Crohn, pode ser necessária uma medicação específica, como a salazossulfapiridina, a mesalazina e a olsalazina. Se o sangue ou o muco forem mais graves, podem também ser utilizados medicamentos hormonais, como a prednisona e a dexametasona. Além disso, se se suspeitar de um tumor gastrointestinal, pode ser necessário efectuar uma gastroscopia com colonoscopia e exames relacionados para excluir outras doenças.