Não existe uma escolha entre gastrostomia ou nasogastrostomia, sendo que a escolha geralmente tem de se basear no tempo que o doente não consegue comer pela boca.
1. alimentação nasogástrica: O doente não pode comer pela boca durante um curto período de tempo, mas pode tolerar a alimentação por sonda gástrica transnasal para ingestão nutricional num prazo de quatro a oito semanas. O paciente pode sofrer de enfarte cerebral, coma e disfagia.
2. gastrostomia: É utilizada principalmente para doentes que não podem comer por via oral durante muito tempo, como os que não podem ser operados a tumores do esófago superior com obstrução ou os que não podem comer após a quimioterapia, mas esperam melhorar a qualidade de vida e realizar actividades humanas normais, e não querem colocar o cateter no interior do nariz, então é melhor realizar a gastrostomia para assegurar a nutrição do corpo humano.
A gastrostomia e a alimentação nasogástrica são ambas medidas de nutrição entérica destinadas a assegurar as necessidades nutricionais normais do organismo, cabendo ao médico profissional decidir qual delas escolher em função da situação.