A vacina contra o HPV não pode ser administrada no primeiro dia da menstruação, principalmente porque a própria vacina contra o HPV tem um certo grau de toxicidade. Por conseguinte, não é recomendável tomar a vacina contra o HPV quando se está a menstruar, mas sim depois de o período ter terminado. Além disso, a vacina contra o HPV não deve ser administrada durante a amamentação, durante a gravidez, se tiver uma doença grave e se estiver constipada ou com febre, não deve ser vacinada.