As causas mais comuns de separação dos seios são os cálculos renais, os cálculos ureterais, a estenose da junção pélvico-ureteral, o aumento ou os tumores da próstata, os tumores do rim e do ureter, os tumores ginecológicos e a fibrose retroperitoneal. A principal causa de acumulação de líquido é a obstrução abaixo da pelve renal, que pode ser causada por vários factores, sendo os mais comuns os cálculos. Só quando estas causas são removidas é que a separação dos seios renais pode ser aliviada. Nalguns casos, a causa da doença não pode ser removida temporariamente, como é o caso dos tumores da próstata ou dos tumores ginecológicos com metástases tão grandes que não é possível a cirurgia.