Há várias razões para dores de estômago a meio da noite. A primeira deve-se a doenças gastrointestinais, incluindo enterite, espasmo intestinal, obstrução intestinal ou obstipação. Estas doenças são causadas por doenças gastrointestinais primárias combinadas com uma constipação a meio da noite, ou comer demasiado ou demasiado antes de ir dormir, o que pode facilmente desencadear dor abdominal a meio da noite. Em segundo lugar, a dor abdominal a meio da noite pode também ser devida a doenças do tracto urinário, incluindo cistite, uretrite e mesmo infecções do tracto urinário superior. Pode também ser uma cólica renal causada por pedras ureterais, que também ocorre facilmente a meio da noite e é muito repentina e intensa.