A síndrome do intestino irritável que causa incontinência fecal deve ser tratada de forma agressiva para a doença primária, bem como sintomaticamente para a incontinência fecal. A síndrome do intestino irritável é mais frequentemente causada por perturbações psicossomáticas. O tipo diarreico é o mais comum, para além dos tipos obstipado e misto. O tratamento mais importante é o alívio das dúvidas e a melhoria da confiança. É possível receber tratamento profissional de um psiquiatra. O tratamento farmacológico pode ser prescrito com medicamentos antidiarreicos, como a loperamida, o difenocumarol, o montelucaste, etc., analgésicos e antiespasmódicos como o brometo de pivacilo, mas também com o uso moderado de psicotrópicos, como a amitriptilina, etc. Recomenda-se que, quando os sintomas da incontinência fecal do síndroma do intestino irritável forem graves, se dirija atempadamente ao hospital habitual, identifique a causa da doença e cumpra as instruções do médico quanto à utilização razoável da medicação.