A injeção de gentamicina não é geralmente utilizada para o tratamento da Helicobacter pylori. A injeção de gentamicina pertence aos antibióticos aminoglicosídeos, teoricamente pode inibir a reprodução e o crescimento do H. pylori, mas existe um certo grau de nefrotoxicidade, pelo que não é adequada para uma utilização a longo prazo, a utilização do ciclo não é geralmente superior a duas semanas. Os doentes com infeção por H. pylori necessitam de normalizar a combinação quádrupla de medicamentos, ou seja, 2 antibióticos, como a amoxicilina e a claritromicina + bismuto + inibidor da bomba de protões, como o omeprazol, por via oral, em combinação. Por conseguinte, na prática, a injeção de gentamicina não é utilizada para tratar a infeção por H. pylori. A injeção de gentamicina pode ser utilizada para tratar a inflamação causada por Escherichia coli, Neisseria, Staphylococcus aureus, etc. É contra-indicada em indivíduos alérgicos, tem ototoxicidade e nefrotoxicidade e recomenda-se a sua utilização sob a supervisão de um médico.