Se a litotripsia a laser for utilizada para pedras urinárias, é realizada principalmente sob anestesia geral para cirurgia. As modalidades podem ser divididas em invasivas e não invasivas. Os procedimentos invasivos são representados por nefrolitotomia percutânea, enquanto os procedimentos não invasivos são baseados na litotripsia laser holmium sob ureteroscopia ou litotripsia laser holmium sob ureteroscopia flexível. Em primeiro lugar, a nefrolitoscopia percutânea requer um canal a ser feito na região lombar para entrar directamente no rim. Após o nefrolitoscópio ter observado a pedra, o laser é introduzido no corpo pelo nefrolitoscópio, e a pedra é completamente quebrada sob visão directa. O laser é então introduzido no corpo através do ureteroscópio ou ureteroscópio flexível, e a pedra é completamente quebrada sob visão directa, momento em que algumas das pedras podem ser expelidas, mas algumas permanecem no corpo.